第一部的结局，作为男主角的杰克最终成为了纳威人的领袖，与涅提妮幸福的生活下去，直到五年之后，第二部剧情的开始，
阿凡达世界里的地球，生态环境已经因为人类的种种破坏而濒临崩溃，各种大小天灾接连不断，必须依靠去外星强取豪夺各类资源才能勉强维持生存。
潘多拉星球的宝贵矿产和自然资源，也许是能够挽救地球的重要力量，成为人类觊觎已久的对象，并悄悄的重返了潘多拉星球，并且在潘多拉的海洋中设立了秘密基地，准备在水下出其不意的向纳威人发动奇袭。
某天，一位纳威族人在海岸附近巡逻时遭到利器割喉身亡，通过现场勘查，以及作为前
海军陆战队员的敏锐直觉，杰克判断已经有人类的阿凡达混入了部落。
接着，杰克利用举办迅雷翼兽（伊卡兰）驯服大赛的活动，揪出伪装成纳威人的人类奸细，并在审问后得知了人类的阴谋。
之后，察觉到计划暴露的人类提前发动进攻，纳威人奋起反抗，人类落入下风，退回水下基地，用特殊的水对地导弹对潘多拉各部族成员及各地的神树狂轰滥炸。
于是杰克派遣了一批部族精英，携带水下呼吸器向着人类海底基地发动了进攻，人类在海底节节败退，水下防御系统也被潘多拉的自然之力摧毁，即将全军覆没之时，人类巨大的飞行战舰已经接近了潘多拉。
杰克知道纳威人不是飞行战舰的对手，无奈之下通过仪式将自己灵魂传导回原来的身体，孤身前往人类战舰，寻求和平解决两族争端的办法，电影就此终结。
回忆完自己曾经看过的这两部电影后，宇智波和彦对于此次任务的世界有了大致的了解。
第一，艾华女神虽然没有现身，但它的存在毋庸置疑，从电影里的剧情来分析，一旦大幅度影响到潘多拉世界的生态环境，就会遭受艾华女神的敌视，派遣世界内的野生动物进行攻击。
第二，存在着艾华女神的潘多拉星球，有些类似于玄幻或者西幻之类的超然世界，但里面却并不存在着超然的能量与技能，这就代表着宇智波和彦无法使用超自然的力量，只能凭借身体与技巧进行战斗。
第三，根据任务的等级评价来看，完成打败矿业公司的任务后，就会有很大的可能性得到艾华女神的认可，最多也就是完成摧毁水下基地的任务，否则，也不会只是一个青铜级的任务了。
得出这三点基础的认知后，宇智波和彦对这次的任务有了一定程度上的把握，当即选择进入阿凡达世界里。