（系统替身不可使用非任务世界内能量与功法，否则会被任务世界本源意志察觉，遭受本源意志的抹杀。）
看完这个最新的任务后，宇智波和彦便开始翻阅自己的记忆，思考有关两部阿凡达世界的剧情。
第一部的剧情，说的是战斗中负伤而下身瘫痪的前海军战士杰克·萨利，替死去的同胞哥哥来到潘多拉星球，操纵用人类基因与纳威人基因结合创造出的一种名为“阿凡达”的混血生物，前往纳威部落与排外的纳威人接触。
这么做的目的，是为了通过外交说服潘多拉的原住民离开世代居住的家园，方便RDA矿业公司砍伐殆尽该地区的原始森林，开采地下昂贵的“不可得”矿石。
在探索潘多拉星的过程中，杰克遇到了纳威部落的公主涅提妮，向她学习了纳威人的生
存技能与对待自然的态度，并在这一过程中爱上了涅提妮与潘多拉星球。
与此同时，RDA矿业公司经理帕克和军方代表迈尔斯上校逐渐丧失耐心，决定诉诸武力驱赶纳威人，并派遣了战机去摧毁纳威人所生存的家园树。
没有了生存之地的纳威人，被迫暂居神树之下，杰克等几位具有正义感的人类，也因帮助纳威人而和采矿公司的利益相冲，被他们关了起来。
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之后，从关押下逃离的杰克，收服了空中霸主魅影，并骑着它返回纳威人暂居的神树，凭借魅影骑士的身份重新得到纳威人的信任，呼吁纳威人作出反抗。
在杰克的呼吁下，他们联络了潘多拉星球上了其他纳威部落的人，一起组建了一支几千人的反抗军，形成了陆空两路的防线，与RDA矿业公司公司的军队展开了血战，却不敌人类的
军队。
在世界意志艾华女神的插手下，潘多拉星球的野生动物们加入到战斗，打败人类军队，并将杰克的精神转移到他的阿凡达身上。