大蛇丸的危机
原本平静的忍界，随着五大忍村的一份对晓组织的联合宣战声明而沸腾起来，一股紧张压抑的气氛顿时笼罩住整个火影大陆。
为了守护整个忍者世界，破坏‘宇智波斑’邪恶的月之眼计划，各方势力暂时抛却了彼此间的矛盾，几乎派出全部的兵力，在雷之国南部集结，组成了人数远超原著的十万忍者联军。
十万名不同国家的忍者，根据各自能力与战略方面的需要，被划分为六支主力的战斗队伍。
一、第一战斗分队。由擅长近战的忍者组建的近战联合军分队，负责在最前线战斗斩杀数量多的敌人。统领为岩忍的黄土。
二、第二战斗分队。成员结构与第一战
斗分队相似，主要负责击杀突破前线的敌人，并在持久战阶段为前线补充足量的战力。统领为木叶的旗木卡卡西。
三、第三战斗分队。由擅长暗器和武器的忍者组建的中距离攻击联合军分队，负责为前线近战分队提供火力支援，统领为云忍的达鲁伊。
四、第四战斗分队。由擅长远距离攻击的忍者组建的远距离战斗联合军分队，负责支援前线并压制敌方的中远距离部队。统领为砂忍的马基。
五、第五战斗分队。由在小南召集下加入联军的雨忍村忍者与诸多晓组织成员组成的混合部队。统领为现已加入木叶村的小南。
六、第六战斗分队。由铁之国武士、小忍村忍者、浪忍、地下黑市赏金忍者组成的混合部队。统领为铁之国的三船。
除了以上这六支人数庞大的主要战斗部
队外，还有五支人数稍少些的辅助型部队。
一、情报解析部队。正副队长分别由山中亥一和青担任，主要负责收集分析情报、将总部下达的指令及时传递到其他部队里。
二、医疗后勤部队。正副队长分别由纲手与静音担任，负责救助伤员与破解晓组织可能使用的毒素袭击。
三、侦查感知部队。正副队长分别由油女志微与希担任，负责感知敌人方位、避免遭受敌军埋伏。